Canon 為旗艦級APS-C數碼單鏡反光相機EOS 7D Mark II配備了全新研發的65點自動對焦系統，是EOS系列中擁有最多自動對焦點*的系統，其發展目標是廣闊覆蓋的f/5.6十字型自動對焦點，讓攝影師能更準確捕捉主體，提供媲美專業級EOS-1D X的自動對焦效能。事實上，65點自動對焦系統正是由EOS-1D X中廣受專業攝影師歡迎的61點自動對焦系統發展而來。
除了全新的65點全十字自動對焦系統感應器外，EOS 7D Mark II的65點自動對焦系統設計中亦與EOS-1D X一樣加入了自動曝光感應器輔助自動對焦分析。其中的自動曝光感應器是一顆全新的150,000像素RGB+IR測光感應器，能配合DIGIC 6數碼影像處理器以EOS iSA 智能主體分析 (EOS Intelligent Subject Analysis)系統分辨觀景器中顏色及面孔，通過EOS iTR智能追蹤及識別 (EOS Intelligent Tracking and Recognition)功能令自動對焦追蹤更穩定。150,000像素RGB+IR測光感應器中更整合了光源檢測感應器，提供更全面資訊令對焦系統能作出更準確判斷，大大加強了對焦精確度。
除了硬件設計外，EOS 7D Mark II配備了與EOS-1D X相同的先進、高度精確AI Servo AF III自動對焦演算法。而EOS 7D Mark II亦與EOS-1D X一樣採用了一個簡單易明的獨立自動對焦設定選單頁，將自動對焦設定及自訂功能集中擺放，方便攝影師能快捷更改自動對焦相關設定。當然EOS 7D Mark II亦備有自動對焦設定工具(AF Configuration Tool)，為攝影師預設了6個適合不同拍攝場景的自動對焦參數「案例」(Case)，拍攝不同主體時便能獲得更佳對焦效果。
EOS 7D Mark II自動對焦系統概念圖
*截至2014年9月15日
EOS 7D Mark II 與EOS-1D X的自動對焦系統比較
| 自動對焦規格 | EOS 7D Mark II | EOS-1D X | ||
| 自動對焦感應器 | 自動對焦點數目 | 65 | 61 | |
| 十字型自動對焦點數目 （最多） |
使用f/2.8鏡頭 | 65 | 41 | |
| 使用f/4鏡頭 | 65 | 41 | ||
| 使用f/5.6鏡頭 | 65 | 21 | ||
| f/2.8或f/5.6雙十字型自動對焦點對焦 | 1 | 5 | ||
| f/4 + f/5.6十字型自動對焦點對焦 | 0 | 20 | ||
| f/8十字型自動對焦點對焦 | 1 | |||
| 兩組自動對焦感應器偏移排列 | f/5.6自動對焦點對焦 | 5 | 所有對焦點^ | |
| f/2.8十字型自動對焦點對焦 | 1 | 5 | ||
| 高離焦(defocus)控制支援 | 1 | 1 | ||
| 對焦亮度範圍 (中央f/2.8自動對焦點、使用單張自動對焦) |
EV -3 - 18 | EV -2 - 18 | ||
| 自動對焦區域選擇模式 | 重點自動對焦 | 有 | ||
| 單點自動對焦 | 有 | |||
| 自動對焦點擴展 | 4點：上、下、左、右 | 有 | ||
| 周邊8點 | 有 | |||
| 區域自動對焦 | 有 | |||
| 大區域自動對焦 | 有 | - | ||
| 自動選擇自動對焦點 (所有自動對焦點) | 有 | |||
| 自動對焦區域選擇桿 | 有 | - | ||
| 人工智能伺服自動對焦 | AI Servo AF III | 有 | ||
| 自動對焦配置工具 | 有 (案例 1-6) | |||
| EOS iTR 自動對焦 | 測光感應器有效像素（約） | 150,000 像素 | 100,000 像素 | |
| 色彩資訊及臉部偵測 | 有 | |||